Антиядерные антитела (антинуклеарные антитела)
Антитела класса IgG к двуспиральной (нативной) ДНК
Антитела к фосфолипидам IgM/IgG 
Антитела к митохондриям 
Антитела к париетальным клеткам желудка 
Антитела к гладкой мускулатуре 
Антитела к базальной мембране клубочков почек IgA, IgM, IgG (анти-БМК)
Антитела к межклеточному веществу и базальной мембране кожи 
Ауто-АТ к сердечной мускулатуре 
Антитела к микросомам печени и почек типа 1 (anti-LKM1) 
Антитела к кератину 
Антитела к фосфатидил-серину IgG+IgM 
Антитела к кардиолипину скрининг - IgG, IgA, IgM 
Антитела к кардиолипину IgA  
Антитела к кардиолипину IgG  
Антитела к цитоплазме нейтрофилов  
Антитела к ретикулину IgA и IgG  
Антитела к эндомизию IgA и IgG 
Антитела к тромбоцитам IgG, непрямой тест 
Антитела к циклическому цитруллинированному пептиду (АЦЦП)  
Антитела к ткани яичника, Ig A,M,G (антиовариальные антитела) 
Антигены главного комплекса гистосовместимости 
Типирование генов HLA II класса – гены DRB1, DQA1, DQB1